Parmi les peintures du musée, on peut signaler un triptyque flamand du XVIe siècle, un portrait du fameux savant humaniste Peiresc, attribué à Finsonius, une Crucifixion peinte sur bois du XVe siècle, en provenance d’Avignon, dix-huit portrait de membres de la famille de Gabriel Honoré Mirabeau, légués à l’Académie par la dernière descendante de cette famille.